Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms