Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN1P18031 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms