Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMD1P17707 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMD1P17707 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMD1P17707 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMD1P17707 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMD1P17707 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMD1P17707 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms