Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB4P17483 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms