Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF3P17036 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms