Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
GCFC2P16383 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms