Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFD2P13995 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD2P13995 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms