Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6P13671 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6P13671 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6P13671 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6P13671 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6P13671 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6P13671 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6P13671 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6P13671 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6P13671 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6P13671 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6P13671 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6P13671 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6P13671 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6P13671 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6P13671 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6P13671 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6P13671 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms