Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT5P13647 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT5P13647 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT5P13647 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT5P13647 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT5P13647 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT5P13647 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT5P13647 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT5P13647 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms