Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC5P13010 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC5P13010 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC5P13010 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC5P13010 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XRCC5P13010 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms