Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESRRAP11474 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms