Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPP1P10451 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPP1P10451 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPP1P10451 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPP1P10451 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms