Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP2BP0DMP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms