Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms