Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM253P0C7T8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM253P0C7T8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM253P0C7T8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM253P0C7T8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM253P0C7T8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms