Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN2P0C2S0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN2P0C2S0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms