Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms