Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TNP1P09430 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms