Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms