Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMBP08949 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMBP08949 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMBP08949 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMBP08949 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMBP08949 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMBP08949 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMBP08949 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMBP08949 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMBP08949 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBP08949 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBP08949 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms