Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NGFRP08138 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NGFRP08138 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NGFRP08138 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms