Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBBP07437 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBBP07437 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBBP07437 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBBP07437 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBBP07437 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBBP07437 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBBP07437 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBBP07437 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms