Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSF1RP07333 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CSF1RP07333 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CSF1RP07333 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSF1RP07333 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms