Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFMP07197 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFMP07197 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFMP07197 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFMP07197 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFMP07197 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFMP07197 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFMP07197 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFMP07197 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFMP07197 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFMP07197 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFMP07197 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFMP07197 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFMP07197 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFMP07197 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms