Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAVP06756 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms