Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDN1P05305 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDN1P05305 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDN1P05305 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDN1P05305 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDN1P05305 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDN1P05305 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDN1P05305 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDN1P05305 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDN1P05305 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDN1P05305 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDN1P05305 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDN1P05305 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDN1P05305 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms