Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1P05023 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms