Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TYMSP04818 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYMSP04818 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TYMSP04818 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYMSP04818 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYMSP04818 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYMSP04818 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TYMSP04818 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TYMSP04818 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYMSP04818 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TYMSP04818 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms