Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms