Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms