Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCAP01258 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCAP01258 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCAP01258 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCAP01258 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCAP01258 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCAP01258 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCAP01258 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCAP01258 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCAP01258 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCAP01258 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCAP01258 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCAP01258 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCAP01258 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCAP01258 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCAP01258 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms