Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED1O96006 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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