Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms