Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYF2O95926 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYF2O95926 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYF2O95926 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYF2O95926 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYF2O95926 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYF2O95926 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYF2O95926 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms