Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms