Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms