Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAPBO95292 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAPBO95292 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VAPBO95292 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAPBO95292 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAPBO95292 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAPBO95292 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms