Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCELO95171 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCELO95171 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCELO95171 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCELO95171 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCELO95171 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCELO95171 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCELO95171 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCELO95171 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCELO95171 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCELO95171 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCELO95171 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCELO95171 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCELO95171 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms