Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms