Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL5O76039 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms