Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBOX1O75936 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms