Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JRKO75564 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JRKO75564 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JRKO75564 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
JRKO75564 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
JRKO75564 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JRKO75564 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JRKO75564 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JRKO75564 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JRKO75564 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JRKO75564 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JRKO75564 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JRKO75564 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JRKO75564 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JRKO75564 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms