Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F6O75461 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F6O75461 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F6O75461 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F6O75461 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F6O75461 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms