Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms