Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPHN1O60890 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPHN1O60890 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms