Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDRD6O60522 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD6O60522 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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