Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PLXNC1O60486 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PLXNC1O60486 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PLXNC1O60486 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms