Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms