Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1G1O43747 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1G1O43747 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms