Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB2O43741 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms